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1.1. La cellule, atome du vivant  Droits d'accès : non autorisé
Description : Bienvenue dans cette introduction conjointe aux notions fondamentales de génomique et d'algorithmique, autrement dit, de l'analyse informatique de l'information génétique, ce qu'on peut désigner de façon très synthétique par le terme un domaine scientifique qui est la bio informatique. Au cours de c ...
Date : 01-06-2015
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1.1. La cellule, atome du vivant
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1.1. The cell, atom of the living world  Droits d'accès : non autorisé
Description : Welcome to this introduction to bioinformatics. We will speak of genomes and algorithms. More specifically, we will see how genetic information can be analysed by algorithms. In these five weeks to come, we will see first, what are these genomic texts, we will try to analyse using algorithms and pro ...
Date : 05-05-2015
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1.10. Des fenêtres glissantes et recouvrantes  Droits d'accès : non autorisé
Description : Notre sympathique algorithme de balade sur l'ADN, a permis de mettre en évidence des biais de composition de séquences, a fait apparaître sur le tracé un point de rebroussement que l'on peut interpréter comme étant l'origine de réplication. On peut donc être fier d'avoir un algorithme qui serait cap ...
Date : 01-06-2015
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1.10. Des fenêtres glissantes et recouvrantes
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1.10. Overlapping sliding window  Droits d'accès : non autorisé
Description : We have made some drawings along a genomic sequence. And we have seen that although the algorithm is quite simple, even if some points of the algorithmare bit trickier than the others, we were able to produce an interesting result that is a prediction of the origin of replication of bacterial genome ...
Date : 05-02-2015
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1.10. Overlapping sliding window
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1.2. At the heart of the cell: the DNA macromolecule  Droits d'accès : non autorisé
Description : During the last session, we saw how at the heart of the cell there's DNA in the nucleus, sometimes of cells, or directly in the cytoplasm of the bacteria. The DNA is what we call a macromolecule, that is a very long molecule. It's Avery, in 1944, who discovered that the DNA was the support of geneti ...
Date : 05-02-2015
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1.2. At the heart of the cell: the DNA macromolecule
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1.2. Au c?ur de la cellule, la molécule d?ADN  Droits d'accès : non autorisé
Description : Au c?ur de chaque cellule se trouve donc la molécule d'ADN, flottant directement dans le cytoplasme dans le cas des cellules procaryotes, par exemple bactériennes, ou contenue dans le noyau des cellules eucaryotes. Que sait-on actuellement de cette molécule d'ADN ? C'est un long parcours là encore ...
Date : 01-06-2015
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1.3. DNA codes for genetic information  Droits d'accès : non autorisé
Description : Remember at the heart of any cell,there is this very long molecule which is called a macromolecule for this reason, which is the DNA molecule. Now we will see that DNA molecules support what is called the "genetic information". So, DNAcodes for genetic information. How? If you consider this doublest ...
Date : 05-02-2015
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1.3. DNA codes for genetic information
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1.3. L?ADN code l?information génétique  Droits d'accès : non autorisé
Description : L'ADN, cette longue molécule, porte l'information génétique. Autrement dit, l'information qui est nécessaire à la cellule pour fonctionner et se reproduire. Regardons de plus près cette information génétique. Nous avons vu comment en lisant la séquence de nucléotides le long d'un brin de l'ADN, on p ...
Date : 01-06-2015
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1.3. L?ADN code l?information génétique
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1.4. Qu?est-ce qu?un algorithme ?  Droits d'accès : non autorisé
Description : Les génomes peuvent donc être vus comme une longue suite de lettres écrites dans l'alphabet : A, C, G et T. Comment interpréter ces textes ? Ça va être le sujet de la bio-informatique à l'aide d'algorithmes appropriés. Qu'entend-on par algorithme ? Un algorithme peut être vu comme une suite d'opér ...
Date : 01-06-2015
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1.4. Qu?est-ce qu?un algorithme ?
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1.4. What is an algorithm?  Droits d'accès : non autorisé
Description : We have seen that a genomic textcan be indeed a very long sequence of characters. And to interpret this sequence of characters, we will need to use computers. Using computers means writing program. Writing program means designing first algorithm. So, let's see what an algorithm is. An algorithm is a ...
Date : 05-05-2015
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1.4. What is an algorithm?
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1.5. Compter les nucléotides  Droits d'accès : non autorisé
Description : Notre premier algorithme vise assez simplement à compter les nucléotides d'une séquence génomique, autrement dit à compter les lettres dans une chaîne de caractères. En entrée, cette chaîne de caractères, encore une fois écrite dans cet alphabet de 4 lettres, et dont la fin est marquée par un caract ...
Date : 01-06-2015
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1.5. Compter les nucléotides
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1.5. Counting nucleotides  Droits d'accès : non autorisé
Description : In this session, don't panic. We will design our first algorithm. This algorithm is forcounting nucleotides. The idea here is that as an input,you have a sequence of nucleotides, of bases, of letters, of characters which ends with a star symbol, here. And, you want to count the number of A,C, G and ...
Date : 05-02-2015
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1.5. Counting nucleotides
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