Informations pratiques sur cette ressource

Description de la ressource pédagogique

Description (résumé)

Dans le cadre du webinaire rBDD du 17 décembre 2020 « Outils de gestion de collections de recherche » Présentation du projet GOTIT (Gene, Occurence and Taxa in Integrative Taxonomy) par Philippe GRISON. GOTIT est une base de données relationnelle et une application Web qui permettent d?optimiserla productivité d?un laboratoire, notamment dans les domaines de la conception de projets derecherche, de l?analyse des biais et de la planification d?échantillonnage, de l?identification des es-pèces, du séquençage de l?ADN, du biobanking, et du transfert des données vers des plateformesmondiales de la biodiversité. GOTIT gère les différentes étapes d?un processus de productionde données d?occurrence d?espèces, allant de l?échantillonnage au séquençage, en passant par lestockage de lots d?individus, de lames et d?extraits d?ADN et leur affectation à des hypothèsesd?espèces fondées sur la morphologie et l?ADN. L?application prend également en compte lesdonnées d?occurrence d?espèces et les métadonnées de séquences d?ADN provenant de sourcesexternes. GOTIT est conçu pour optimiser les activités de recherche sur la diversité et l?évolution desespèces à forte composante géographique, telles que la biogéographie et la phylogéographie.Une caractéristique clé de GOTIT est sa capacité à assigner de multiples hypothèses d?espècesfondées sur des méthodes de délimitation morphologiques et moléculaires à un même ensembled?individus. Une autre caractéristique clé est la traçabilité, qui favorise la répétabilité scientifiqueet le partage des tâches entre utilisateurs

"Domaine(s)" et indice(s) Dewey

• Biodiversité. Environnement, protection, conservation (577.1)
• Fichiers et bases de données (005.74)
• Architecture et conception des bases de données, fichiers et systèmes de gestion de bases de données (005.74)

Thème(s)