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<title><string language="fre"><![CDATA[1.8. Changer l’échelle du chemin]]></string></title>
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<string language="fre"><![CDATA[Dans la session précédente, je vous ai proposé de m'accompagner dans une balade sur l'ADN. En fait un parcours de la séquence avec un tracé de segments, dont l'orientation dépendait de la lettre courante de la séquence et on a vu que ceci nous permettait effectivement de tracer un chemin. Et nous avons vu aussi très vite que nous étions rejoints par des contraintes matérielles qui étaient la taille de l'écran, le nombre de pixels qu'on pouvait afficher sur un écran, qui nous interdisait a priori d'afficher le tracé de l'ADN d'un génome de plusieurs millions de caractères.
Comment résoudre le problème ? 
La réponse, c'est, eh bien on va changer l'échelle du dessin. Tout simplement de façon à ce que ce dessin puisse tenir systématiquement dans un écran de taille raisonnable. Quel est le principe ? Rappelez-vous, on a dessiné, tracé des segments, 4 segments différents suivant la lettre courante en cours de lecture dans la séquence. Et nous obtenons des chemin de ce genre-là. Donc a priori, vous voyez qu'on pourrait très vite, même si on faisait des segments plus petits, sortir de l'écran. Comment faire ? Eh bien au lieu de tracer tous les segments, on va en tracer un tous les N segments. Ici par exemple, au lieu de tracer tout ce chemin-là, je me contenterai de tracer celui-ci, et ensuite celui-ci et ensuite celui-ci. Là où il y avait 10 segments ou 15 segments ou 20 segments, j'en trace un. Et donc évidemment, je vais compacter mon chemin qui devrait pouvoir mieux tenir dans un écran. Je peux prendre un facteur de compaction de 10, de 15, de 20, voire de 1 000 si j'ai envie et si c'est nécessaire...]]></string></description>
<keyword><string language="fre"><![CDATA[génomique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[algorithmique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[bioinformatique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[biologie cellulaire et moléculaire]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[modélisation]]></string></keyword>
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FN:Francois RECHENMANN
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NOTE: Ingénieur et Docteur-Ingénieur en informatique, François Rechenmann est chercheur au centre Inria Grenoble – Rhône-Alpes. Il y exerce ses activités à l’interface de l’informatique et des sciences du vivant en contribuant plus particulièrement au développement de méthodes et de logiciels pour l’analyse des séquences génomiques des microorganismes. Cofondateur de la société Genostar, qui propose des solutions bioinformatiques aux industries pharmaceutiques, agroalimentaires et biotechnologiques, il en est le conseiller scientifique. Très impliqué dans les actions de médiation scientifique, François Rechenmann est le responsable scientifique du site Interstices dont l’objectif est d’expliquer l’informatique en tant que domaine de recherche. 
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FN:Thierry PARMENTELAT
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NOTE:Thierry Parmentelat a mené une carrière hybride entre les mondes académique et industriel. Ses centres d'intérêt couvrent les langages de programmation, les réseaux, et l'algèbre. Actuellement ingénieur de recherche chez Inria, Thierry Parmentelat utilise Python depuis plus de 10 ans pour ses travaux de recherche, ainsi que pour le développement des plateformes expérimentales dont il a la charge. 
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Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusés sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre originale.]]></string>
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