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<title><string language="fre"><![CDATA[1.6. Contenu en G-C et A-T des séquences]]></string></title>
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<string language="fre"><![CDATA[Les algorithmes qui travaillent sur les séquences génomiques, sur les textes génomiques, doivent produire des résultats interprétables et utiles aux biologistes. Nous allons voir que même sur l'algorithme très simple que nous avons construit de comptage de nucléotides, eh bien cet algorithme produit des résultats qui ont effectivement 
Revenons sur cet algorithme. Souvenez-vous : déclaration des variables, des entités, que nous allons manipuler dans l'algorithme, initialisation de ces variables. Si vous n'initialisez pas les variables correctement, les comptages ne partiront pas de la bonne valeur. Donc initialisation des variables. Et ensuite, les instructions proprement dites. Ici, identification "Est-ce que c'est un A, un G, un T ? " et incrémentation du compteur correspondant. Incrémentation du nombre de caractères, indépendamment que ça soit un A, C, G ou T. Et progression de l'index le long de la séquence jusqu'à ce qu'on arrive sur le caractère qui marque la fin de la séquence. 
Cet algorithme doit effectivement exposer ces résultats et c'est pour ça que nous avions rajouté des ordres d'affichage, de longueur de la séquence avec le compteur total NB et du pourcentage de A dans la séquence, de C, de G et de T à travers ces formules de calculs très simples...]]></string></description>
<keyword><string language="fre"><![CDATA[génomique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[algorithmique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[bioinformatique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[biologie cellulaire et moléculaire]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[modélisation]]></string></keyword>
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FN:Francois RECHENMANN
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NOTE: Ingénieur et Docteur-Ingénieur en informatique, François Rechenmann est chercheur au centre Inria Grenoble – Rhône-Alpes. Il y exerce ses activités à l’interface de l’informatique et des sciences du vivant en contribuant plus particulièrement au développement de méthodes et de logiciels pour l’analyse des séquences génomiques des microorganismes. Cofondateur de la société Genostar, qui propose des solutions bioinformatiques aux industries pharmaceutiques, agroalimentaires et biotechnologiques, il en est le conseiller scientifique. Très impliqué dans les actions de médiation scientifique, François Rechenmann est le responsable scientifique du site Interstices dont l’objectif est d’expliquer l’informatique en tant que domaine de recherche. 
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FN:Thierry PARMENTELAT
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NOTE:Thierry Parmentelat a mené une carrière hybride entre les mondes académique et industriel. Ses centres d'intérêt couvrent les langages de programmation, les réseaux, et l'algèbre. Actuellement ingénieur de recherche chez Inria, Thierry Parmentelat utilise Python depuis plus de 10 ans pour ses travaux de recherche, ainsi que pour le développement des plateformes expérimentales dont il a la charge. 
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Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusés sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre originale.]]></string>
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